云南省环境监测中心站始建于1974年，是全民所有制社会公益性科研技术事业单位，隶属于云南省环境保护厅，业务上受中国环境监测总站的指导，是国家环境监测一级站和国家环境监测网成员单位。是云南省环境监测工作的业务技术中心、资料信息中心、网络中心和培训中心。

主要承担云南省行政管辖范围内的环境质量监测、污染源监测;突发性污染事故及仲裁监测;室内空气监测及社会委托监测;编写全省环境质量报告书、环境监测年鉴等各类专题技术报告;全省环境监测网络的业务组织协调、技术交流和监测人员培训和环境科学研究;全省有机食品认证管理等，其宗旨是为环境决策管理提供技术支持、为环境执法实施技术监督、为社会经济建设提供技术服务。

云南省环境监测中心站培养、聚集了一批具有较高学术和技术水平的监测骨干队伍，现有职工89人，各类专业技术人员76人，其中正高级工程师2人，高级工程师16人，工程师29人。拥有4888M2的办公实验楼，共有价值1098万元的各种监测仪器及辅助设备316台(套)，其中有气相色谱/质谱联用仪、气相色谱仪、高效液相色谱仪、电感耦合等离子体发射光谱仪、离子色谱仪、原子吸收光谱仪等现代化大型分析仪器。站内设有大气监测室、水质监测室、物理监测室、生态监测室、技术服务部、综合室、质量技术管理室、有机食品办、财务科、行政科和办公室等11个科室。

云南省环境监测中心站拥有完善的质量保证体系和较强的监测技术能力，可出具准确可靠的监测数据。在国家环境监测总站的多次考核中，均获得优异成绩。在大气、噪声、地表水、酸雨等环境要素上相继成为国家监测网络成员单位。1994、2000、2003年先后三次通过了由国家质量技术监督局、国家环境保护总局组织的计量认证评审及扩项监督评审，确认本站具备向社会提供水和废水(含大气降水和水生物);环境空气和废气;土壤、底质、煤质、固体废物(含降解塑料);植物、农作物、蔬菜、水产品;噪声、振动;电磁辐射、电离辐射;机动车排放污染物;室内空气共八大类242个监测项目的资格(《计量认证合格证书》的编号为(2000)量认(国)字(Ul280)号)。

云南省环境监测中心站经三十年的监测实践及科研工作，开展了80余个国家、省及国际合作科研项目，其中“昆明三聚磷酸钠厂环境影响评价研究”、“开远市区域环境质量评价及综合防治对策研究”、中美合作“全球内陆降水背景值调查与研究”、“昆河线外向型经济带红河州经济与环境协调发展规划”等37项获得国家、省、地厅级科技成果(或进步)奖。受到国家环保总局和省环保局的多次表彰和奖励，2002年被国家环保总局授予“‘九五’期间全国环保系统先进环境监测站”光荣称号。