为规范发展公益事业，阿里巴巴集团及旗下子公司联合成立的“阿里巴巴公益基金会”已于2011年通过国家民政部批准审核批准，马云成为该基金会第一号志愿者。2010年5月，阿里巴巴集团宣布从2010年起将集团年收入的0.3%拨作公益基金，主要用于环境保护，是国内互联网企业首家环境保护基金。阿里巴巴公益基金会的宗旨是：营造公益氛围，发展公益事业，促进人与社会、人与自然的可持续发展。资助重点包括：水环境保护，环境保护宣传，以及支持环保类公益组织的发展。与其他非公募基金会不同的是，阿里巴巴公益基金会主要以环境保护作为公益方向，将企业平台模式及资源融入到公益领域，让公益项目得以保持持续、健康发展，通过电子商务生态体系帮助了全球中小企业和创业者得到生存和发展，不仅授之于鱼更是授之于渔。以阿里援建的青川公益项目为例，在重建过程中，阿里巴巴集团通过帮助青川本地年轻人开设50多家网店，以销售蜂蜜、木耳、香菇等农副产品发展生计，2011年仅在线销售额便超过500万元，帮助400多户农民增收，促进灾区经济可持续发展。