重庆医药工业研究院成立于1950年，是西南地区主要从事化学药物研究开发的专业研究开发的高科技型企业。2001年，作为重庆市首批改制科研院所之一，由上海复星医药产业发展有限公司与重庆化医控股（集团）公司合资组建成立重庆医药工业研究院有限责任公司(以下简称“重庆医工院”)。2019年9月，重庆药友制药有限责任公司全资控股重庆医工院。现已经建成了从创新药物开发、合成工艺研究、制剂处方工艺研究、分析方法学研究、药理毒理评价等完整规范的药物研发体系。